Pojazdy wyłamują się jednak z tradycji krakowskiej komunikacji miejskiej, bowiem były pomalowane na żółto (miasto Kraków w przetargu nie określiło jakiego koloru mają być autobusy, jedynie zaleciło udział barwy niebieskiej). Dzięki temu jednak, bardzo łatwo było odróżnić autobusy firmy Mobilis od autobusów MPK S.A. w Krakowie. Od 2010 roku do 18 kwietnia 2011 Mobilis obsługiwał linię 417 Łuczanowice – Ruszcza CmentarzKomunikat MPK Kraków S.A., dlatego sprowadził do obsługi tej linii z innego oddziału mikrobus Iveco TurboDaily 45-12 oraz od 28 grudnia 2010 aglomeracyjną linię przyspieszoną 301 na trasie Dworzec Płaszów – Niepołomice. 7 lipca 2012 uruchomiono linię 352 Aleja Przyjaźni – Kryspinów. Linia kursowała w soboty i niedzielę, jednak tylko w dni słoneczne. Dnia 26 sierpnia 2012 linia została zlikwidowana. Od 29 czerwca do 1 września 2013 ponownie uruchomiono linię do Kryspinowa w soboty i niedziele.

Mobilis w dniu 1 kwietnia 2008 podpisał umowę z miastem Kraków na obsługę trzech linii komunikacji miejskiej w Krakowie i aglomeracji krakowskiej. Od 1 maja 2008 Mobilis obsługuje w Krakowie linię 152 na trasie Aleja Przyjaźni – Olszanica.