W wyniku kłopotów z zakupem fabrycznie nowego taboru oraz z procedurami rejestracji autobusów, linie 178 (Pod Fortem – Mistrzejowice) i 304 (Wieliczka – Dworzec Główny Zachód) na zlecenie Mobilisa obsługiwało jeszcze przez pewien czas MPK S.A. w Krakowie. Obsługę tych dwóch linii Mobilis przejął dopiero dnia 8 czerwca 2008. Firma Mobilis kupiła nowe autobusy do tego celu. Jest to 10 sztuk przegubowych Solarisów Urbino 18 z klimatyzacją oraz 16 krótkich autobusów Irisbusów Citelis 12M wraz z klimatyzacją. Nowe pojazdy wyłamują się jednak z tradycji krakowskiej komunikacji miejskiej, bowiem są pomalowane na żółto (miasto Kraków w przetargu nie określiło jakiego koloru mają być autobusy, jedynie zaleciło udział barwy niebieskiej). Dzięki temu jednak, bardzo łatwo jest odróżnić autobusy firmy Mobilis od autobusów MPK S.A. w Krakowie. Od 2010 roku do 18 kwietnia 2011 Mobilis obsługiwał linię 417 Łuczanowice – Ruszcza Cmentarz, dlatego sprowadził do obsługi tej linii z innego oddziału mikrobus Iveco TurboDaily 45-12 oraz od 28 grudnia 2010 aglomeracyjną linię przyspieszoną 301 na trasie Dworzec Płaszów – Niepołomice. 7 lipca 2012 uruchomiono linię 352 Aleja Przyjaźni – Kryspinów. Linia kursowała w soboty i niedzielę, jednak tylko w dni słoneczne. Dnia 26 sierpnia 2012 linia została zlikwidowana.