Zmarł w nocy z niedzieli na poniedziałek (4 lutego 2008) w swym domu. Pozostawił żonę Joannę i córkę Marcelinę. Został pochowany na cmentarzu komunalnym przy ul. Wiślanej. 21 października 2008 jego grób został przeniesiony na cmentarz Starofarny przy ul. Grunwaldzkiej w Bydgoszczy.
W maju 2009 roku Rada Miasta Bydgoszczy nadała nazwę Bulwar Sebastiana Malinowskiego, północnej części bulwaru Kanału Bydgoskiego, między ulicami Bronikowskiego a Wrocławską Bulwar Sebastiana Malinowskiegow Mapy Google Bulwar Sebastiana Malinowskiego w Bydgoszczy w Targeo.
Wybrane publikacje Historia i teraźniejszość III Liceum Ogólnokształcącego w Bydgoszczy (1997, współautor, ) Bydgoski węzeł wodny: materiały pokonferencyjne z pierwszego sympozjum historyczno-literackiego, z okazji uroczystej inauguracji działalności Muzeum Kanału Bydgoskiego (2006, redakcja, )
Przypisy
Zobacz też Muzeum Kanału Bydgoskiego Muzeum Wolności i Solidarności w Bydgoszczy
Bibliografia Romaniuk Marek: Sebastian Malinowski (1970–2008) – bydgoszczaninowi pro memoria. [w.] Kronika Bydgoska XXXIX s.