Następnie mówiło się o transferze do Dinama Zagrzeb oraz Kataru, ale ostatecznie w styczniu 2006 zawodnik podpisał umowę z MKE Ankaragücü. Natomiast w sezonie 2006/2007 występował w Istanbulsporze.
SezonKlubKrajRozgrywkiMeczeBramki1994–1995FK SarajevoPremijer liga ? ?1995–1996BursasporSuperliga2791996–1997BursasporSuperliga31211997–1998BursasporSuperliga29121998–1999Fenerbahçe SKSuperliga30181999–2000Real MadrytPrimera División1112000–2001Fenerbahçe SKSuperliga2752001–2002Rayo VallecanoPrimera División1012002–2003Galatasaray SKSuperliga1622003–2004Fenerbahçe SKSuperliga802004/05Fenerbahçe SKSuperliga1012004–2005KonyasporSuperliga1422005–2006MKE AnkaragücüSuperliga2372006–2007IstanbulsporSuperliga2592007–2008IstanbulsporSuperliga71
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Bośni i Hercegowiny Baljić zadebiutował w 1996 roku. Przez 10 lat w kadrze narodowej wystąpił 39 razy i strzelił 14 goli. Jest jedynym bośniackim piłkarzem, który w meczu reprezentacji zdobył 4 gole w jednym spotkaniu. Miało to miejsce w 1999 roku, a Bośnia pokonała Estonię 4:1.