Paznokcie dłoni chorych na zespół paznokieć-rzepka mogą cechować różne nietypowe zmiany kształtu i budowy (zniekształcenia, niedokształcenie), ich nasilenie jest zróżnicowane u poszczególnych osób, ale dotyczą w największym stopniu paznokci kciuków. Unikalną cechą tego zespołu są obłączki (białe elementy u nasady paznokci) w kształcie przypominającym zazwyczaj trójkąty, nie zaś – tak jak u osób zdrowych i niedotkniętych tym zespołem – półkola/półksiężyce. Natomiast paznokcie stóp chorych na zespół paznokieć-rzepka mogą być dotknięte efektami wadliwego genu znacznie rzadziej i w mniejszym stopniu (mogą być to głównie hipoplastyczne paznokcie małych palców – V-ych – u stóp lub/i małe albo brakujące obłączki u paznokci stóp).
Inne składowe zespołu, które mogą występować – z różną częstotliwością i różnym stopniem zaawansowania u poszczególnych osób chorych – to: zwapnienia tylnych części stawów biodrowych (tzw. rogi biodrowe / rogi Fonga - stożkowate wyrostki talerzy biodrowych uważane za patognomoniczne dla zespołu paznokieć-rzepka, u większości pacjentów z NPS możliwe do wykrycia przy pomocy celowanej rentgenodiagnostyki) nieprawidłowości budowy stawów łokciowych, które mogą objawiać się np.