Zmodernizowany MKX otrzymał nową, mocniejszą jednostkę napędową V6 o pojemności 3,7 litra i większej mocy 309 KM, dalej współpracując z 6-biegową automatyczną skrzynią biegów.
Silniki 2007-2010: V6 3.5l 269 KM
2010-2015: V6 3.7l 309 KM
Druga generacja
thumb|225px|left|Lincoln MKX II - tył thumb|225px|left|Lincoln Nautilus - model po liftingu thumb|225px|left|Lincoln Nautilus - tył po liftingu
Lincoln MKX II został zaprezentowany po raz pierwszy w 2015 roku.
Zupełnie nowa, druga generacja MKX miała swoją premierę 8 lat od debiutu poprzednika podczas styczniowego Detroit Auto Show. Samochód został zbudowany od podstaw jako nowa konstrukcja oparta na zmodernizowanej platformie Forda, ponownie współdzieląc ją z równolegle debiutującą kolejną generacją bliźniaczego Forda Edge'a. Stylistykę samochodu zapowiedział przedstawiony w poprzedzającym roku podczas Shanghai Auto Show prototyp Lincoln MKX Concept.