W 1664 r., w rok po poświęceniu Mampuku-ji, Yinyuan przekazał stanowisko opata swemu uczniowi, który przybył z Chin – Mu’anowi Xingtao (1611–1684) i przeniósł się do małej świątyni Shōin-dō w granicach kompleksu Mampuku-jiMampuku-ji otrzymał 8,900 hektarów ziemi..
Pomimo tego przez 10 następnych lat kontynuował pracę nad stworzeniem nowych reguł klasztornych dla jego szkoły, które znane są pod nazwą Ōbaku shingi. Innym ważnym tekstem jest Sandan kaie regulujący ceremonię wyświęcania pełnych mnichów.
Zmarł w Uji w 1673 r.
Linia przekazu Dharmy zen Pierwsza liczba oznacza liczbę pokoleń mistrzów od 1 patriarchy indyjskiego Mahakaśjapy.
Druga liczba oznacza liczbę pokoleń od 28/1 Bodhidharmy, 28 patriarchy Indii i 1 patriarchy Chin.
Trzecia liczba oznacza początek nowej linii przekazu w danym kraju. 53/26 Wuzhun Yuanzhao (Wuzhun Shifan) (1177–1249) 54/27 Xueyan Huilang (Zuqin) (bd) 55/28 Gaofeng Yuanmiao (1238–1295) 56/29 Wenjian Guixin (zm. 1322) mistrzyni chan 56/29 Zhongfeng Mingben (1263–1323) 57/30 Qianyan Yuanzhang (1284–1357) 58/31 Wanfeng Shiwei (1313–1381) 59/32 Baozhang Puchi 60/33 Dongming Huichan (1372–1441) 61/34 Haizhou Puci (1393–1461) 62/35 Baofeng Mingxuan (zm. 1472) 63/36 Tianqi Benrui (zm. 1503) 64/37 Wuwen Mingcong (zm.