W obliczu takiego dyplomatycznego zachowania musiałem rozważyć zakończenie mojej misji”.
8 lutego 1945 wbrew woli papieża złożył rezygnację ze stanowiska nuncjusza w Niemczech i opuścił Berlin w obliczu sukcesu operacji wiślańsko-odrzańskiej nacierającej Armii Czerwonej, Orsenigo przeniósł się do Eichstätt w Bawarii, gdzie zmarł 1 kwietnia 1946. Został pochowany 24 kwietnia 1946 obok rodziców na cmentarzu w Olginate. Pogrzebowi przewodniczył kard. Alfred Schuster.
Nuncjatura utraciła swój oficjalny status w maju 1945 r., wraz z klęską nazistowskich Niemiec, chociaż Aliancka Rada Kontroli zezwoliła Orsenigowi na pozostanie w Eichstätt. Orsenigo zmarł w Eichstätt w dniu 1 kwietnia 1946 r. Jego adiutant, prałat Carl Colli pozostał jedynym pośrednikiem między Piusem XII a Kościołem niemieckim. Colli zmarł w styczniu 1947 r., pozostawiając swojego sekretarza prałata Bernarda Hacka w Eichstätt. Po długim bezkrólewiu, podczas którego Pius XII polegał na księdzu Igo Zieglerze z Villi Grosch w Kronbergu, następnym nuncjuszem był Aloisius Joseph Muench.