obiektów archeologicznych i 12 700 obiektów historycznych.
Wybrane zbiory: Dział Sztuki Polskiej i Europejskiej – zespół gotyckich witraży, skarb ze Skrwilna (wykonane ze srebra przedmioty z XVI i XVII wieku), dwa szafowe zegary podłogowe z I. poł. XVIII wieku, stołowe zegary kaflowe z I. poł. XVIII wieku, Bestia z Apokalipsy Albrechta Dürera, XV-wieczne drzeworyty nieznanego autorstwa, ryciny z Cronica mundi Hartmanna Schedla, ryciny artystów niderlandzkich, portrety, twórczość malarska i graficzna m.in: Marcella Bacciarellego, Tytusa Czyżewskiego, Jacka Malczewskiego, Jana Matejki, Józefa Mehoffera, Piotra Michałowskiego, Józefa Pankiewicza, Wojciecha Weissa, Stanisława Ignacego Witkiewicza, Stanisława Wyspiańskiego. Dział Archeologii – zbiory archeologiczne z ziemi chełmińskiej, ziemi dobrzyńskiej i Kujaw od końca epoki lodowej do nowożytności.