Wersje samolotu Ar 96 Samolot był budowany w wielu wersjach o różnych przeznaczeniach: Ar 96V – prototypy samolotu. Ar 96A-0 – seria informacyjna, zbudowano 6 sztuk w 1939 roku. Ar 96A – pierwsza wersja produkcyjna, zbudowano 92 sztuki w latach 1939–1940. Ar 96B-0 – druga wersja samolotu, zbudowano 2 sztuki w 1940 roku. Ar 96B-1 – nieuzbrojona wersja samolotu do treningu pilotażu, zbudowano 1381 sztuk w latach 1940–1944. Ar 96B-3 – wersja uzbrojona w stały karabin maszynowy umieszczony obok silnika, do szkolenia myśliwskiego, zbudowano 210 sztuk w latach 1941–1944. Ar 96B-6 – wersja do szkolenia pilotów myśliwskich, zbudowano 100 sztuk, w latach 1943–1944. Ar 96B-7 – wersja wyposażona w wyrzutniki bomb, przeznaczona do szkolenia pilotów samolotów szturmowych i samolotów nurkujących, zbudowano 896 sztuk w latach 1944–1945. Ar 96B-8 – ulepszona wersja samolotu Ar 96B-7, zbudowano 155 sztuk w latach 1944–1945. Avia C-2 – wersja budowana po II wojnie w Czechosłowacji na podstawie dokumentacji samolotu Ar 96B, wersja niejednolita, poszczególne samoloty różniły się wyposażeniem i zastosowaniem (szkolenie pilotażu myśliwskiego, bombardowania, pilotażu bez widoczności ziemi i nocnego), zbudowano 394 sztuki w latach 1945–1949.
thumb|Samolot Arado Ar 96B-1 w Muzeum Techniki w Berlinie