Na początku 2009 roku w reklamie telewizyjnej marcowego numeru Newtype pojawiła się informacja, że druga seria będzie miała swoją premierę w kwietniu 2009 roku, co jednak później zostało zdementowane przez przedstawiciela Kadokawa Shoten Animation Group, który poinformował, że informacja zawarta w reklamie dotyczy ponownej emisji pierwszej serii anime. Na początku kwietnia 2009 roku, za pośrednictwem przedstawiciela stacji Teletama pojawiła się informacja, że rzekoma „reemisja” serii będzie składała się z 28 odcinków, co z kolei doprowadziło do spekulacji, że oprócz emisji pierwszej serii zostanie wyemitowany także nowy materiał. Ostatecznie odcinki pierwszej i drugiej serii zostały wmieszane między siebie i wyemitowane w fabularnej kolejności chronologicznej. Emisja rozpoczęła się 2 kwietnia 2009 roku. Pierwszym wyemitowanym odcinkiem tym razem był Melancholia Haruhi Suzumiyi I, natomiast pierwszy odcinek drugiej serii, zatytułowany , został wyemitowany 22 maja 2009 roku, jako ósmy odcinek serialu. TVNumer odcinka w emisji i chronologicznie względem serii pierwszej #Numer odcinka w serii Tytuł Premiera