Leczenie i rokowanie Największe ryzyko zgonu dotyczy pierwszych dni, tygodni i miesięcy życia, przede wszystkim z powodu sepsy, odwodnienia, zaburzeń elektrolitowych i niewydolności oddechowej. Dlatego leczenie od pierwszych chwil życia wymaga intensywnej, wielospecjalistycznej opieki neonatologicznej. Obejmuje ona m.in. utrzymywanie odpowiedniej temperatury i wilgotności, nawadnianie, kontrolę gospodarki elektrolitowej, żywienie, profilaktykę i leczenie zakażeń, ochronę oczu oraz systematyczną pielęgnację skóry. Podstawowe znaczenie mają emolienty, natłuszczanie i nawilżanie skóry, które pomagają ograniczać pękanie naskórka, utratę wody i ryzyko infekcji. W leczeniu stosuje się także retinoidy miejscowe i/lub ogólnoustrojowe, które mogą przyspieszać oddzielanie grubych płyt rogowych i zmniejszać nadmierne rogowacenie skóry.
W badaniu z 2011 roku obejmującym 45 przypadków, całkowita przeżywalność wynosiła 56%, a osoby żyjące w momencie badania miały od 10 miesięcy do 25 lat. Przeżywalność wynosiła 83% u dzieci, w których zastosowano leki retinoidowe. Autorzy podkreślili, że rybią łuskę arlekinową należy traktować jako ciężką chorobę przewlekłą, która nie zawsze jest śmiertelna.