Mangi JPF różnią się także układem – większość serii zachowuje japoński porządek stron (układ oryginalny), jednak są i takie, które prezentują lustrzane odbicie oryginału (układ stron od lewej do prawej).
Serie wydawnicze Mega Manga W 2011 roku JPF rozpoczął nową serię wydawniczą o nazwie Mega Manga. Ideą tej serii jest wydawanie w Polsce klasyki japońskiego komiksu, a także prezentowanie polskiemu czytelnikowi niekasowych tytułów, które jednak posiadają wartość fabularną lub artystyczną. Cykl nie został oficjalnie odwołany, jednak od 2020 w jego ramach nie ukazał się już żaden tytuł.
Wielka Kolekcja Horrorów Junjiego Ito Od listopada 2014 roku startuje seria, która ma na celu wydanie wszystkich mang Junjiego Ito wyjąwszy te opublikowane w serii Mega Manga.
Wydane mangi Tytuł Data pierwszegopolskiego wydania Liczbatomów/zeszytów pierwszego polskiego wydania Uwagi 7 miliardów igieł 2013 2 Seria JPF Mega Manga. .hack//Bransoleta Zmierzchu 2005 3 Abara 2014 1 Seria JPF Mega Manga.Akira 1999–200319 Układ odwrócony względem oryginału. W latach 2020-2023 wydano także w 6-tomowej edycji specjalnej. All You Need Is Kill 2014 2 Angel Sanctuary 2007–2009 10 Na podstawie II japońskiego wydania – wersja 10-tomowa, dodatki: pocztówki (dodawane tylko przy zamówieniu w sklepiku JPF).