6 lutego 2021 papież Franciszek po raz pierwszy od powołana do życia Synodu powołał na stanowisko podsekretarza Synodu Biskupów pierwszą kobietę (zakonnicę) posiadającą prawo głosu w Synodzie Biskupów – s. Nathalie Becquart MCJ (ksawerianka), dotychczasową konsultantkę Sekretariatu Generalnego Synodu (2019–2021).
Obecny zarząd Synodu Dla każdego zebrania Synodu Biskupów ustanawia się ponadto jednego lub kilku sekretarzy specjalnych, mianowanych przez Papieża. Ich urząd wygasa w momencie zakończenia zebrania SynoduKodeks Prawa Kanonicznego, Kan. 348 § 2.
Sekretarz: kard. Mario Grech (od 15 IX 2020) Podsekretarz: s. Nathalie Becquart MCJ (od 6 II 2021)
Papież a Synod Papież jest zwierzchnikiem Synodu, co wyraża się przez: zwoływanie Synodu, ilekroć Papież uzna to za wskazane, wraz z wyznaczaniem miejsca obrad; zatwierdzanie wyboru członków, oznaczanie i mianowanie członków; ustalanie zagadnień, jakie mają być rozpatrywane w odpowiednim czasie przed zebraniem się Synodu; ustalanie porządku obrad; przewodniczenie Synodowi (bezpośrednio lub pośrednio); zamknięcie, przeniesienie, zawieszenie i rozwiązanie SynoduKodeks Prawa Kanonicznego, Kan.