Zróżnicowanie Czaszki ludzi znacznie różnią się w zależności od rasy, płci (dymorfizm płciowy), wieku oraz charakteryzują się dużą zmiennością indywidualną.
Rozwój Czaszka jest złożoną strukturą, a jej kości powstają zarówno w wyniku kostnienia na podłożu błoniastym, jak i na podłożu chrzęstnym. Kości sklepienia czaszki, obejmujące kości szkieletu twarzowego oraz ściany i sklepienie mózgoczaszki, powstają w procesie kostnienia na podłożu błoniastym, choć kości skroniowe rozwijają się w wyniku kostnienia chrzęstnego. Endokranium, czyli kości stanowiące podporę dla mózgu (kość potyliczna, klinowa i sitowa), powstaje w dużej mierze poprzez kostnienie chrzęstne. W związku z tym kości czołowa i ciemieniowe są całkowicie pochodzenia błoniastego. Geometria podstawy czaszki i jej dołów — przedniego, środkowego i tylnego — zmienia się bardzo szybko. Szczególnie przedni dół czaszki ulega istotnym przekształceniom w pierwszym trymestrze ciąży, a w tym okresie często mogą się rozwijać wady czaszki. Wzrost przedniego dołu czaszki w okresie prenatalnym nie przebiega równomiernie. W pierwszym trymestrze obserwuje się wzrost allometryczny, przy czym wymiar podłużny zwiększa się z 5 do 17 milimetrów między 8. a 14. tygodniem życia płodowego.