[…] Byłabyż to jaskółka zwiastująca wiosnę i idące za nią ocieplenie w stosunkach artystycznego Olimpu z masowym widzem? Pierwszy sygnał wprowadzanej w kinematografii reformy?Inaczej film przyjął Michał Boni, który w recenzji dla „Kina” ostro krytykował zamysł Gradowskiego. Według Boniego jedyną zaletą Akademii pana Kleksa było twórcze wykorzystanie utworów Jana Brzechwy zespolone z grą aktorską Fronczewskiego, „niejako wbrew Gradowskiemu”, którego krytyk uznawał zaledwie za imitatora Stevena Spielberga i Walta Disneya.
Janina Brzechwa, wdowa po Janie Brzechwie, wyraziła dezaprobatę wobec adaptacji filmowej. Wprawdzie w przypadku Akademii przyznała, że film „jeszcze jako tako zgadzał się z tym, co napisał Brzechwa”, ale późniejsze kontynuacje uznała za „całkowitą fantazję pana Gradowskiego”.