Na mocy decyzji ks. kardynała Adama Stefana Sapiehy z dniem 29 czerwca 1948 kościół stał się świątynią powołanej wówczas samodzielnej parafii św. Floriana w Zabłociu.
W 1953 ukończone zostało wznoszenie wieży, w związku z czym wszystkie prace budowlane zostały zakończone. Kościół został konsekrowany 7 sierpnia 1955 przez ks. bp. Franciszka Jopa.
W okresie sprawowania stanowiska proboszcza w latach 1975–1984 przez ks. Eugeniusza Górę posadzka prezbiterium kościoła została wyłożona marmurem.
W latach 1991–1992 z inicjatywy ówczesnego proboszcza ks. Józefa Jani został przeprowadzony generalny remont kościoła. Podłoga w prezbiterium została wówczas podniesiona na wysokość kilku stopni i zostało one wyłożone marmurem karraryjskim, natomiast do apsydy dobudowana została zakrystia o dużej powierzchni. Wstawione zostały także nowe ołtarze.
W latach 2005–2006 doszło do wymiany pokrycia dachu kościoła na nową blachę miedzianą oraz przeprowadzone zostało malowanie jego wnętrza.
Architektura mały|Widok od absydy (2008) Projektantem kościoła był Bronisław Błasiak z Żywca, a prace budowlane przeprowadziło przedsiębiorstwo Józefa Kadra z Kalnej.