Podział systematyczny rodziny thumb|Szakłak pospolity thumb|Pomaderris paniculosa W obrębie rodziny wyróżnia się trzy główne grupy, w tym dwie tradycyjnie wyróżniane podrodziny Rhamnoideae i Ziziphoideae oraz grupę Ampeloziziphoids obejmującą trzy monotypowe plemiona Ampelozizypheae, Bathiorhamneae, Doerpfeldieae. W obrębie Rhamnoideae wyróżniane są trzy plemiona, w obrębie Ziziphoideae – pięć. Szereg rodzajów ma niepewną pozycję w tej klasyfikacji i przypisane są one prowizorycznie jako rodzaje incertae sedis do różnych podrodzin:
Podrodzina Rhamnoideae Eaton
Plemię Ventilagineae Bentham & J.D. Hooker Smythea A. Gray Ventilago Gaertner
Plemię Rhamneae Horaninow Atadinus Rafinesque Auerodendron Urban Berchemia Candolle Berchemiella Nakai Condalia Cavanilles Dallachya F. Mueller Endotropis Rafinesque Frangula Miller – kruszyna Karwinskia Zuccarini Krugiodendron Urban Reynosia Grisebach Rhamnella Miquel Rhamnidium Reissek Rhamnus L. – szakłak Sageretia Brongniart Scutia Brongniart
Plemię Maesopsideae Engler & Weberbauer Maesopsis Engler
incertae sedis: Ventia Hauenschild Pseudoziziphus Hauenschild
Podrodzina Ziziphoideae Luersson