Na początku 2000 roku José powrócił na Półwysep Apeniński i przeszedł do A.C. Milan. W Mediolanie przegrywał jednak rywalizację z innymi bocznymi obrońcami jak Serginho, Thomas Helveg czy Kacha Kaladze. Jedynym sukcesem za czasów gry w Rossonerich było zdobycie Pucharu Włoch w 2003 roku. Przez 3,5 roku Argentyńczyk wystąpił zaledwie w 49 spotkaniach. Latem 2003 przeszedł do hiszpańskiego drugoligowca CD Leganés, ale zaliczył tam tylko jeden występ. Ostatnie dwa lata kariery spędził w Rosario Central, ale z powodu kontuzji rozegrał tylko 4 spotkania. Ostatecznie w 2006 roku postanowił zakończyć sportową karierę. Liczył sobie wówczas 37 lat.
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Argentyny zadebiutował 31 października 1993 roku w zremisowanym (1:1) spotkaniu z Australią, rozegranym w ramach barażu o awans do Mistrzostw Świata 1994.
Rok później został przez Alfio Basile powołany na ten turniej. W USA był podstawowym zawodnikiem Argentyny i wystąpił we wszystkich meczach tej drużyny: grupowych z Grecją (4:0), Nigerią (2:1) i Bułgarią (0:2), a także w 1/8 finału z Rumunią (2:3).
Cztery lata później na Mundialu we Francji 1998 wystąpił w czterech spotkaniach: z Japonią (1:0), Jamajką (5:0), w 1/8 z Anglią (2:2, p.k 4:3) i ćwierćfinale z Holandią (1:2).