Obecnie zbiory historyczne i artystyczne liczą łącznie ponad 63 tys. obiektów. Są to dokumenty życia społecznego, przedmioty kultury materialnej, mapy, plany, plakaty, fotografie, negatywy, pocztówki, obrazy, grafiki, rzeźby, medale i tkaniny artystyczne. Zaś księgozbiór naukowy to ponad 11 tys. woluminówMuzeum Miasta Gdyni - informacje. Gdynia 2020.
Bardzo poważne zwiększenie się ilości zgromadzonych obiektów od chwili powstania Muzeum jest miarą życzliwości społeczności lokalnej, która w postaci darowizn przekazuje Muzeum obiekty wartościowe pod względem historyczno-dokumentacyjnym oraz artystycznym. Jest to również miara aktywności zespołu Muzeum, który poprzez umiejętne działania promocyjne, aktywne poszukiwania oraz realizowane zakupy pozyskuje nowe obiekty. Zadaniem zespołu jest również opracowanie naukowe każdego z pozyskanych przedmiotów. Dzięki temu dziesiątki tysięcy obiektów stały się źródłem wiedzy o przeszłym i aktualnym życiu miasta i jego mieszkańców.