Na początku 1928 r. wystąpił w roli pośrednika między dyrektorem Departamentu Nauki i Szkół Wyższych Ministerstwa WRiOP Stanisławem Michalskim a Piłsudskim i Prezydentem Rzeczypospolitej Ignacym Mościckim. Pośrednictwo to doprowadziło do zainicjowania dwóch spotkań na Zamku Królewskim w Warszawie, w których wzięli udział: Józef Piłsudski, Ignacy Mościcki, Stanisław Michalski oraz Artur Śliwiński. Podjęto wówczas decyzję o realizacji koncepcji Funduszu Kultury Narodowej.
Urząd ministra sprawował do 27 czerwca 1928 r, kiedy ustąpił cały rząd Piłsudskiego.
Od 1928 mieszkał w Warszawie, gdzie prowadził prywatną praktykę lekarską.
II wojna światowa Do wybuchu wojny światowej pracował w Warszawie jako lekarz specjalizujący się w chirurgii i ginekologii.
Zmarł 12 czerwca 1943 i został pochowany na warszawskich Powązkach (kwatera 284a wprost-5-17).
W 2022 roku z inicjatywy premiera Mateusza Morawieckiego, Fundacja ,,Stare Powązki" w ramach projektu odrestaurowywania grobów ministrów II RP, odnowiła grób ministra Dobruckiego.mały|Grób Gustawa Dobruckiego po renowacji (2023) Życie prywatne Jego małżonką była Janina z domy Berezowska, z którą miał córkę i syna.