Organy Historia Organy z 1951 roku wybudowane zostały przez firmę Stockmann jako instrument o 31 (według katalogu 29) głosach dla kościoła św. Klemensa w Dortmundzie. Po translokacji do Braniewa instrument został rozbudowany o kolejne 9 głosów w sekcji manuału II, na którą przygotowane było miejsce w stole gry. Montaże i rozbudowę ukończono w październiku 2017 roku, a przeprowadził je organmistrz Tomasz Szałajda.
Dyspozycja Manuał IManuał IIManuał IIIPedał1. Bordun 16'1. Rohrgedackt 8'1. Geigenprinzipal 8'1. Prinzipalbass 16'2. Prinzipal 8'2. Quintade 8'2. Flute harmonique 8'2. Subbass 16'3. Gedackt 8'3. Prinzipal 4'3. Dolce 8'3. Zartbass 16' *4. Salizional 8'4. Blockflöte 44. Schwebung 8'4. Octavbass 8'5. Oktave 4'5. Flageolett 2'5. Rohrflöte 4'5. Gedacktbass 8'6. Gemshorn 4'6. Sifflöte 1 1/3'6. Prästant 4'6. Choralbass 4'7. Rauschpfeife 2 2/3'7. Nachthorn 1'7. Nasat 2 2/3'7. Waldflöte 2'8. Mixtur 5-6fach8. Cymbel 2-3 fach8. Oktave 2'8. Hintersatz 5fach9. Fagott 16'9. Krummhorn 8'9. Hohlflöte 2'9. Posaune 16'10. Trompete 8'10. Terz 1 3/5'10. Fagott 16' (tr. I)11. Scharff 4fach11. Trompete 8'12. Dulzian 16'13. Oboe 8'