Waldeyer oferował swoją czaszkę, mózg oraz dłonie na użytek Instytutu Anatomii w Berlinie.
W 1923 Hans Virchow opublikował pracę o dłoniach Waldeyera.
Wybrane prace 1862 De claviculae articulis et functione. Berlin 1862 (dysertacja doktorska) 1863 Untersuchungen über den Ursprung und den Verlauf des Achsenzylinders bei Wirbellosen und Wirbeltieren, sowie über dessen Endverhalten in der quergestreiften Muskelfaser. Zeitschrift für rationelle Medicin 20, 193-256 (1863) Über die Endigung der motorischen Nerven in den quergestreiften Muskeln. Centralblatt für die medicinischen Wissenschaften (1863) 1864 Untersuchungen über die Entwicklung der Zähne. Danzig, 1864 Anatomische und physiologische Untersuchungen über die Lymphherzen der Frösche. Zeitschrift für rationelle Medicin (1864) 1865 Die Veränderungen der quergestreiften Muskelfasern beim abdominaltyphus. Centralblatt für die medicinischen Wissenschaften (1865) Grosses Lipo-Myxom des Mesenteriums mit secundären sarcomatösen Heerden in der Leber und Lunge. Virchows Archiv für pathologische Anatomie und Physiologie und für klinische Medizin (1865) 1866 Lienale Leukämie mit ausgebreiteten Neubildungen in Leber und Nieren. (1866) Tuberkulose des Myocardiums und des Gehirns. (1866) 1867 Die Entwicklung der Carcinome.