Pół roku później batalion ten przemianowano ponownie na 2 batalion miotaczy ognia i przydzielono go do OW Poznań. W połowie 1947 w 2 bmo zwiększono stan osobowy batalionu o 40%. Rok później miała miejsce następna zmiana etatu, która spowodowała dalsze zwiększenie liczebności stanu osobowego batalionu kolejne 18%.
W 1949 batalion był jedyną samodzielną jednostką wojsk chemicznych. Jesienią 1950 batalion miotaczy ognia przeniesiono z Modlina do Orzysza, a pół roku później przeformowano go na nowy etat zwiększający liczbę żołnierzy z 261 do 322. Pół roku później 2 bmo przeformowano na nowy etat o stanie osobowym 370 żołnierzy.
Na początku 1953 przeprowadzono redukcję wojska. 2 batalion miotaczy ognia został zmniejszony do 275 żołnierzy.
W 1964 2 batalion zadymiania i miotaczy ognia został przeformowany w 2 batalion zabiegów specjalnych i rozpoznania skażeń, a w 1968, na bazie batalionu utworzono 2 Pomorski pułk chemiczny.
Struktura organizacyjna w okresie wojny Dowództwo i sztab 3 x kompanie miotaczy ognia 3 x plutony miotaczy ognia kompania ciężkich karabinów maszynowych kompania samochodowa 3 x plutony samochodowe pluton remontowo-transportowy warsztat samochodowy pluton dowodzenia i zwiadu pluton łączności sekcja sanitarna