Budżet w 2007, w obliczu nadchodzących wyborów, przewidywał największy wzrost wydatków w historii Irlandii, które zostały przeznaczone na podwyżki emerytów i zasiłków socjalnych, program ochrony środowiska i zrekompensowanie obniżki najwyższej stawki podatkowej z 42% do 41%.
14 czerwca 2007, po wygranych wyborach parlamentarnych, objął dodatkowo urząd wicepremiera (tánaiste), pozostając ministrem finansów.
Lider partii i premier thumb|170px|Brian Cowen (z lewej) oraz Colin Powell, 2001 Brian Cowen wielokrotnie był wymieniany w mediach jako potencjalny nowy lider Fianna Fáil. Jego pozycja w partii wzmocniła się, gdy w 2002 objął funkcję wicelidera partii po rezygnacji Mary O’Rourke.
2 kwietnia 2008 premier Bertie Ahern zapowiedział złożenie z dniem 6 maja rezygnacji ze stanowiska premiera i lidera FF z powodu oskarżeń o korupcję (do jakiej miało dojść w latach 90.). 4 kwietnia 2008 Brian Cowen uzyskał wsparcie swojej kandydatury ze strony wszystkich pozostałych członków gabinetu. 9 kwietnia 2008 został oficjalnie wybrany na lidera partii, funkcję tę objął 6 maja 2008, tuż po oficjalnej rezygnacji poprzednika.