Jednocześnie, w celu uniknięcia wewnętrznych utarczek, nakazał im wymarsz w kierunku granicy, pod pretekstem ochrony ziem przed Tatarami.
W Petersburgu Połubotok złożył prośbę o przywrócenie na Naddnieprzu starych praw i zwyczajów, z których najważniejszym był postulat wyboru hetmana. Zwrócił uwagę, że według prawa nadanego przez Bohdana Chmielnickiego nikt nie ma prawa do ingerowania w sądownictwo kozackie, natomiast na porządku dziennym było narzucanie sądom woli namiestników rosyjskich. W tym samym czasie wojsko kozackie stacjonujące nad rzeką Kołamak wysłało do cara skargę w podobnym tonie, oskarżając namiestników rosyjskich o samowolę i ucisk, w której prosiło o pozwolenie na wybór nowego hetmana według starego prawa.
Na rozkaz cara hetman i przybyła z nim starszyzna zostali aresztowani i osadzeni w twierdzy Pietropawłowskiej.
W więzieniu Zgodnie z legendą Pawło Połubotok miał obrazić Piotra Wielkiego, pouczając go, że gnębienie Kozaków i miejscowej czerninie przystoi carowi, a sławę i wdzięczność przyniesie mu sprawowanie władzy nad narodem wolnym, a przez to wdzięcznym swojemu władcy. Hetman dowodził, iż za wierną służbę państwu jedyną zapłatą jest carski gniew i ucisk.