Przede wszystkim wzmocnił obronę portu, a zwłaszcza bastionu Martinengo – znakomitego przykładu nowoczesnego budownictwa obronnego.
Turcy wylądowali na Cyprze 3 lipca 1570 roku. Nikozja padła po dwóch miesiącach; jej garnizon został zmasakrowany. Wicekról (locumtenens regni) Niccolò Dandolo napisał do Bragadina, by był gotów na uderzenie nieprzyjaciela.
Oblężenie Famagusty Turcy podeszli pod Famagustę we wrześniu; osmańska artyleria przez wiele miesięcy próbowała skruszyć mury miasta. Marco Antonio Bragadin dowodził, jego zastępcą był Lorenzo Tiepolo, a dowódcą obrony portu generał Astorre Baglioni.
Według weneckich kronikarzy (liczby przez nich podawane są raczej wątpliwe) około 6-tysięczny garnizon bronił miasta przeciwko 200 000 Turków z 1500 działami i 150 okrętami blokującymi port. W rzeczywistości siły tureckie nie przekraczały 70 000 z kilkudziesięcioma działami i kilkoma galerami.