29 sierpnia 2011 został zaprzysiężony na stanowisku.

Premier Bhattarai jako priorytet swojego rządu ogłosił zakończenie procesu pokojowego po wojnie domowej, w tym integrację do wojska 19 tys. byłych bojowników maoistowskich, pozostających wciąż w obozach w całym kraju, a także zakończenie procesu uchwalenia nowej konstytucji. Zapowiedział, iż jego celem będzie stworzenie szerokiego koalicyjnego rządu, a także walka z ubóstwem i bezrobociem.

W czasie pełnienia mandatu nie był jednak w stanie doprowadzić do uchwalenia ustawy zasadniczej i przełamania impasu politycznego w tym względzie. Jedną ze spornych kwestii pozostawała sprawa podziału terytorium kraju na jednostki administracyjne. Podczas gdy strona rządowa opowiadała się za oparciem administracji lokalnej na kryterium etnicznym, opozycja była temu przeciwna, obawiając się wzmocnienia regionalnych antagonizmów i wzrostu zagrożenia dla integralności państwa. W maju 2012 Sąd Najwyższy sprzeciwił się kolejnemu, już piątemu z kolei, przedłużeniu mandatu Zgromadzenia Konstytucyjnego. Wobec tego, w dniu jego wygaśnięcia 28 maja 2012, zostało ono rozwiązane, a rząd zadecydował o rozpisaniu nowych wyborów na 22 listopada 2012.