Kamenice) będąc prawym dopływem Łaby odprowadza wody do Morza Północnego.
Ważniejsze rzeki polskiej części Gór Izerskich to Kamienica, Kamienna i Kwisa – dopływy Bobru, a po stronie czeskiej Smědá (Witka), Jeřice, Řasnice i Lomnice – dopływy Nysy Łużyckiej. Wszystkie one należą do dorzecza Odry.
Skłon południowo-wschodni należy do dorzecza Izery, skłon południowo-zachodni, zachodni i północno-zachodni do dorzecza Nysy Łużyckiej, skłon północny do dorzecza Kwisy, skłon wschodni do dorzecza Bobru.
Wzdłuż górnej Izery, płynącej w obrębie obniżenia śródgórskiego, która tu silnie meandruje, wykształciły się największe powierzchniowo w Sudetach torfowiska.
Wody mineralne W Górach Izerskich wody mineralne występują głównie w strefie uskokowej w rejonie Świeradowa – Czerniawy. Wody te należą do nisko mineralizowanych szczaw wodorowęglanowo-wapniowo-magnezowych z zawartością żelaza, fluoru oraz radonu.
Po raz pierwszy lecznicze działanie wód, naukowo stwierdziła komisja powołana przez Hrabiego Schaffgotscha w 1739 roku, i wkrótce powstały tu pierwsze domy zdrojowe.