Zgodnie z ustawą do głównych zadań Kolegium należy formułowanie ocen i wyrażanie opinii w sprawach:
powoływania i odwoływania Szefa ABW, Szefa AW, Szefa Służby Kontrwywiadu Wojskowego, Szefa Służby Wywiadu Wojskowego oraz Szefa Centralnego Biura Antykorupcyjnego; kierunków i planów działania służb specjalnych; szczegółowych projektów budżetów służb specjalnych, przed rozpatrzeniem ich przez Radę Ministrów; projektów aktów normatywnych i innych dokumentów rządowych dotyczących działalności służb specjalnych; wykonywania przez służby specjalne powierzonych im zadań zgodnie z kierunkami i planami działania tych służb; rocznych sprawozdań przedstawianych przez Szefów z działalności podległych im służb specjalnych; koordynowania działalności Służb Specjalnych, a także ich działalności z Policją, Strażą graniczną, Żandarmerią Wojskową, Biurem Ochrony Rządu, Służbą Cywilną, urzędami skarbowymi, izbami skarbowymi, organami kontroli skarbowej, organami informacji finansowej oraz służbami rozpoznania Sił Zbrojnych Rzeczypospolitej Polskiej, a także ich współdziałania w dziedzinie ochrony bezpieczeństwa państwa. współdziałania podmiotów, o których mowa w art.