Był to pierwszy raz, kiedy zespół z Opolszczyzny znalazł się w krajowej czołówce. mały|Zawodnicy Pogoni: (od lewej) Rogowski, Chadryś, Rowiński, Markiewicz i Pałka (1963) Swój pierwszy sezon w II lidze, 1962/1963, Pogoń zakończyła na dziewiątej pozycji w tabeli, z bilansem 8 zwycięstw i 12 porażek. Uchwałą Głównego Komitetu Kultury Fizycznej i Turystyki z 7 maja 1963 centralna II liga koszykówki została rozwiązana. Tym samym Pogoń Prudnik wróciła do ligi okręgowej. Kolejny sezon, 1963/1964, klub zakończył na pierwszej pozycji w tabeli ligi okręgowej, zdobywając tytuł mistrza Opolszczyzny, po czym przystąpił do turnieju barażowego o awans do I ligi, rozegranego w dniach 13–15 marca 1964 w Poznaniu. Wzięły w nim udział drużyny: Pogoń Prudnik, Zastal Zielona Góra, AZS Poznań i Ślęza Wrocław. Pogoń nie wygrała żadnego spotkania i nie uzyskała awansu do I ligi.