Jan Magnussen (ur. 4 lipca 1973 w Roskilde) – duński kierowca wyścigowy i kierowca fabryczny General Motors, były kierowca Formuły 1. Wzrost 170 cm. Żonaty z Christiną. Jest ojcem Kevina Magnussena kierowcy startującego w Formule 1 i wyścigach długodystansowych.
Życiorys Magnussen zdominował w 1994 mistrzostwa Brytyjskiej Formuły 3, jeżdżąc dla ekipy Paul Stewart Racing. Wygrał wtedy 14 z 18 wyścigów, bijąc poprzedni rekord, który należał do Ayrtona Senny.
W roku 1995 został kierowcą testowym zespołu McLaren w Formule 1. Zadebiutował tym samym roku w Grand Prix Pacyfiku w zastępstwie Miki Häkkinena. W wyścigu zajął 10. miejsce. Był to jego jedyny start w Formule 1 w tamtym sezonie.
W roku 1996 wystartował w czterech wyścigach serii CART w zespole Penske Racing w zastępstwie Paula Tracy'ego i Emersona Fittipaldiego. Najlepszy wynik jaki osiągnął to 8 miejsce w wyścigu na torze Laguna Seca.
Rok później wrócił do Formuły 1, bowiem zainteresował się nim zespół Stewart Grand Prix. W 24 wyścigach w sezonach 1997 – 1998 zdobył zaledwie jeden punkt i w połowie sezonu, dokładnie po Grand Prix Kanady, został zastąpiony przez Josa Verstappena. W sezonie 1998 wystartował jeszcze w jednym wyścigu American Le Mans Series.