W 1934 roku opublikował artykuł Hitler, der wissenschaftliche Psycholog, w którym przypisał Hitlerowi wrodzone umiejętności psychologaW. Poppelreuter, Hitler der politische psychologe, „Friedrich Mann pädagogisches Magazin”, Langesalza: Beyer and Sohne Vlg, 1934.. W okresie III rzeszy Poppelreuter pracował jako konsultant w Deutsches Institut für Nationalsozialistische Technische Arbeitsforschung und -schulung (DINTA) w Düsseldorfie.
W 2003 roku niemieckie czasopismo „Nervenarzt” opublikowało artykuł biograficzny na temat Poppelreutera, bez odniesienia się do nazistowskich wątków w jego biografiiG.R. Fink, Walter Poppelreuter (1886–1939), „Nervenarzt” 2003;74: s. 540–541.. W następnych numerach pisma opublikowano listy od protestujących przeciwko temu czytelnikówP. Frommelt, Walter Poppelreuter, „Nervenarzt” 2003;74:1137.L. Orth, Walter Poppelreuter, „Nervenarzt” 2004;75: s. 609–610..