7 października 1938 o godzinie 16:25 przez Jarnołtówek przejeżdżali m.in. Adolf Hitler i feldmarszałek Hermann Göring, którzy po wizytacji Kraju Sudetów udali się do Prudnika na pociąg, którym wrócili do Berlina. W okresie II wojny światowej w Jarnołtówku pracowali robotnicy przymusowi z Polski, m.in. z miejscowości Będzin. Walki w 1945 ominęły Jarnołtówek. Żołnierze Volkssturmu wysadzili we wsi cztery mosty, a następnie wieś została splądrowana przez Armię Czerwoną. Wieś została przejęta przez polską administrację. Wówczas w Jarnołtówku została osiedlona część polskich repatriantów. Niemieckojęzyczna ludność została wysiedlona na zachód w 1946.
W latach 1945–1950 Jarnołtówek należał do województwa śląskiego, a od 1950 do województwa opolskiego. W latach 1945–1954 wieś należała do gminy Głuchołazy, w latach 1954–1969 do gromady Głuchołazy, w latach 1969–1972 do gromady Moszczanka w powiecie prudnickim, a w latach 1972–1975 do gminy Prudnik.