Układ rozrodczy i rozmnażanie Minogi są rozdzielnopłciowe, zapłodnienie jest zewnętrzne. Mają pojedynczy gruczoł rozrodczy męski lub żeński. Po dojrzeniu jaja lub plemniki wydostają się do jamy ciała, z której dostają się do zatoki moczowo-płciowej, a następnie na zewnątrz. Minogi nie odżywiają się podczas wędrówki godowej, co powoduje uwstecznienie przewodu pokarmowego. Po odbyciu godów giną. Stadium larwalne (ślepica, zwana też robaczycą) znacznie różni się od osobników dorosłych. Żyje zagrzebana w mule rzecznym; przeobraża się po 2–4 latach.
Klasyfikacja Rząd Petromyzontiformes jest taksonem monofiletycznym. Dyskusyjna pozostaje jego pozycja filogenetyczna względem śluzic i pozostałych kręgowców, dlatego przez różnych autorów klasyfikowany jest w gromadzie Cephalaspidomorphi, Petromyzonti, Cyclostomata lub Hyperoartia.
Do minogokształtnych zaliczane są współcześnie żyjące gatunki klasyfikowane w rodzinach: Petromyzontidae – minogowate Geotriidae Mordaciidae oraz wymarła rodzina: Mayomyzontidae
Geotriidae i Mordaciidae występują na półkuli południowej, a Petromyzontidae na północnej.