Ponieważ współczesne wersje Windows Mobile zgodne są z .NET, tworzenie aplikacji jest bardzo proste i w niewielkim stopniu różni się od tworzenia aplikacji dla systemów Windows.
Nawigacja Ponieważ znaczna część Pocket PC wyposażona jest we wbudowany odbiornik GPS, a do większości pozostałych, odbiornik taki można podłączyć przez Bluetooth, urządzenia takie doskonale sprawdzają się jako nawigacja tak samochodowa (najpopularniejsze aplikacje to Automapa oraz Tom-Tom) jak i piesza (Pocket Streets) czy lotnicza (OziExplorer CE).
Rozrywka Jednym z zastosowań palmtopów z systemem Windows Mobile jest rozrywka. Urządzenia potrafią płynnie odtwarzać muzykę i filmy w różnych formatach (MPEG-4 część 2 w tym DivX i Xvid; FLV i wiele innych). Oprócz licznych gier stworzonych specjalnie dla Pocket PC istnieje także możliwość emulacji innych platform.
Emulatory: Final Burn, emulator gier arcade. PocketUAE, emulator Amigi, port UAE. CastCE.