Podczas Spring Stampede '99, Juvi stoczył pojedynek z Blitzkriegiem, który później przez wielu został uznany najlepszą walką tego roku. Później Juvi pełnił rolę komentatora na WCW Thunder po tym, jak doznał kontuzji. Juvi często imitował The Rocka nazywając siebie 'The Juice' i używając jego catch phrases, co strasznie irytowało publiczność. Dołączył do Reya Mysterio, Konnana, Kidmana i reszty grupy Filthy Animals. Jako członek tej stajni Juvi wraz z Reyem Mysterio zostali WCW World Tag Team Champions. Juvi został zwolniony z WCW pod koniec 2000 roku po „incydencie” w Australii, gdzie Juvi przyniósł wstyd WCW. Mówiło się, że Juventud był pod wpływem narkotyków i biegał nago wokół hotelu strasząc mieszkających w nim ludzi.
Scena niezależna Guerrera zaczął występować dla wielu niezależnych federacji takich jak: Xtreme Pro Wrestling, CMLL, WWA, AAA, oraz FWA. Juventud często walczył w zespole z Reyem Mysterio, do czasu gdy Rey podpisał kontrakt z WWE. Niebawem Guerrera rozpoczął pracę w TNA.