Nagrody i wyróżnienia 1995 – „Krakowianin Roku” (wraz z Józefem Tischnerem) 1995 – członkostwo honorowe The Royal College of Physicians w Londynie za odkrycie zaburzeń krzepnięcia krwi w chorobach serca 1997 – Lancet Invesigators Award czasopisma „The Lancet” za odkrycie podłoża genetycznego astmy oskrzelowej (wraz z Markiem Sanakiem) 1998 – Nagroda Fundacji na rzecz Nauki Polskiej w dziedzinie nauk przyrodniczych i medycznych „za wykrycie mechanizmu przeciwzakrzepowego działania aspiryny oraz badania nad patogenezą i metodami leczenia astmy oskrzelowej indukowanej aspiryną” 1999 – tytuł doktora honoris causa Akademii Medycznej we Wrocławiu 2001 – nagroda Amerykańskiej Akademii Alergii i Immunologii 2001 – tytuł doktora honoris causa Akademii Medycznej w Warszawie 2002 – tytuł doktora honoris causa Śląskiej Akademii Medycznej w Katowicach 2002 – Nagroda Krakowska Książka Miesiąca (za książkę Katharsis.