Gdy sytuacja stawała się dramatyczna, z odsieczą przybyło kilka republikańskich kanonierek z armią klonów i mistrzem Yodą na ich czele. Rozpoczęła się bitwa o Geonosis. Anakin i Obi-Wan podążyli za uciekającym hrabią Dooku do hangaru, gdzie stoczyli z nim walkę na miecze świetlne. Kenobi doznał ciężkich obrażeń i nie mógł kontynuować walki. W jego obronie stanął młody Skywalker, któremu po długiej walce Dooku odciął prawą rękę. Niezdolnego do walki Anakina uratował Yoda, któremu przeciwnik uciekł po krótkiej walce.
Skywalkerowi podłączono biomechaniczną rękę ze stali i pasowano na rycerza Jedi, a Obi-Wan trafił na leczenie i dostał tytuł mistrza. Dooku z kolei przybył na Coruscant, gdzie spotkał się ze swym mistrzem – najpotężniejszym żyjącym Mrocznym Jedi – Darthem Sidiousem, zwanym też Lordem Sithów. Hrabia oznajmia mu, iż rozpoczęły się wojny klonów, co było częścią wielkiego planu Sidiousa.
Setki tysięcy żołnierzy-klonów przygotowuje się do odlotu na wojnę. Z kolei na spokojnej planecie Naboo Padmé i Anakin potajemnie biorą ślub.