Miasto rozwijało się odtąd bez przeszkód aż do 1870, kiedy to strawił je pożar, który rozprzestrzenił się z miejscowej piekarni. Spłonęło ponad sto domów w mieście, w tym budynek siedziby władz miasta wraz z archiwum, a 130 rodzin zostało z dnia na dzień bezdomnymi. Ogólnokrajowa zbiórka pieniężna pozwoliła na szybką odbudowę miasta. W XX wieku Bodegraven rozrosło się. W pierwszej dekadzie tego stulecia rozbudowano je w kierunku południowym do linii kolejowej, a w latach 50. XX wieku w kierunków północnym, do trasy A12 .
Teoria spiskowa Według pewnej teorii spiskowej w latach 80. XX wieku na terenie Bodegraven działała satanistyczna sekta pedofilów powiązana z rytualnymi morderstwami dzieci. Jednym z jej członków miał być szef Holenderskiego Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego i Środowiska. Takie informacje upowszechniało od 2020 r. trzech użytkowników platformy Twitter (Joost Knevel, Micha Kat, Wouter Raatgever – trafili oni do więzienia, lecz w związku z inną sprawą). W związku z upowszechnieniem się teorii spiskowej do miasteczka zaczęły przybywać tłumy ludzi, którzy składali kwiaty i zostawiali listy na lokalnych grobach dzieci, chcąc oddać cześć ofiarom sekty. W lipcu władze miasteczka zażądały od Twittera usunięcia postów nt. owej teorii spiskowej.