Możliwy jest ruch graniczny również przez port morski w Nowym Świecie.
Infrastruktura portowa Łączna długość nabrzeży w porcie Elbląg wynosi 3,686 km, w tym 0,3 km nabrzeża pasażerskiego. W porcie znajduje się 5 basenów, stocznia remontowa, suwnica o udźwigu 150 ton, obrotnica statków o długości 120 metrów, bocznica kolejowa oraz terminale przeładunkowy i pasażerski.
Działalność W 2008 roku Urząd Morski w Gdyni zanotował 14 zawinięć jednostek, które z Morza Bałtyckiego przez Cieśninę Piławską, dotarły do portu w Elblągu. Statki wykonały rejsy na trasach do europejskich miast: Antwerpii, Gdańska, Hamburga oraz Królewca. Ruch towarowy w porcie Elbląg obsłużyły dwie jednostki: MV Tanais oraz MV Barbara Dinfo.elblag.pl: Kontrowersyjny raport zamiast odpowiedzi przyniósł wiele pytań..
W 2010 przywrócono żeglugę pasażerską między portami: Elbląg-Krynica Morska-Elbląg, którą obsługiwał statek MS Anita.
Przed agresją Rosji na Ukrainę 24 lutego 2022, 96% wymiany towarowej w elbląskim porcie odbywało się z portami obwodu królewieckiego. Wycofanie się przez port jako pierwszy w Polsce z rozładunku rosyjskiego węgla, wprowadzenie zakazu eksportu materiałów budowlanych i cementu spowodowało załamanie się przeładunkówPort w Elblągu handlował głównie z Rosją.