Pierwsze światło pierwszego teleskopu VLT. 1999: Obserwacje rozpoczyna 67-megapikselowa kamera WFI na teleskopie 2,2-metrowym. Oficjalne otwarcie Obserwatorium Paranal. 2000: Działa czwarty teleskop VLT. Portugalia dołącza do ESO. 2001 – Pierwsze światło interferometru VLTI. 2002: Obserwacja najdalszej znanej grupy galaktyk (13,5 mld lat świetlnych) Pomiar średnicy Proximy Centauri za pomocą interferometru VLTI. Wielka Brytania wstępuje do ESO. 2003: Bezpośrednie wyznaczenie rozmiarów kątowych gwiazd alfa Centauri A i alfa Centauri B. Obserwacje rozpoczyna spektrograf HARPS na teleskopie 3,6 metrowym. Rozpoczęcie budowy sieci radioteleskopów ALMA. 2004: Finlandia dołącza do ESO. Najdokładniejszy pomiar dowodzący, że fundamentalne stałe fizyczne nie zmieniają się w czasie.Pierwsze zdjęcie planety pozasłonecznej (2M1207b). 2005 – Pierwsze światło teleskopu submilimetrowego APAX. 2006: Hiszpania wstępuje do ESO.