Potomstwo Jerzy z Podiebradów był dwukrotnie żonaty. w 1441 roku poślubił Kunegundę ze Šternberka, która zmarła w 1449. Rok później zawarł drugi związek małżeński z Joanną z Rožmitálu (zm. 1475). Z pierwszego małżeństwa miał sześcioro dzieci: Boczek (1442–1496) Wiktoryn (1443–1500), od 1459 roku książę Rzeszy, książę ziębicki, opawski i hrabia kłodzki Barbara (1446–1474) Henryk Starszy (1448–1498), od 1462 książę Rzeszy, książę ziębicki, oleśnicki, wołowski i hrabia kłodzki Katarzyna (1449–1464), królowa węgierska, żona Macieja Korwina Zdeňka (Sidonie) (1449–1510), księżna saska, żona Albrechta Odważnego.
Z drugiego małżeństwa Jerzy z Podiebradów doczekał się czworga dzieci: Henryk Młodszy (Hynek) (1452–1492), od 1462 roku książę Rzeszy, książę ziębicki i hrabia kłodzki Fryderyk (1453–1458) Jerzy (1454/1455–1459/1462) Ludmiła (1456–1503), żona Fryderyka I, księcia legnickiego.
Upamiętnienie Mimo że Jerzy nie ustanowił na tronie królestwa własnej dynastii, jako pierwszy rodzimy władca na tronie od wygaśnięcia Przemyślidów cieszył się estymą rodaków, zwłaszcza w czasach XIX-wiecznego czeskiego odrodzenia narodowego. W 1896 wystawiono mu konny posąg w Pradze autorstwa Bohuslava Schnircha.