3. sezon Społeczność jest wstrząśnięta wypadkiem lotniczym. Skyler postanawia odejść od Walta i kontaktuje się z prawnikiem. Walt wyjawia żonie, czym tak naprawdę się zajmuje. Jesse wstrząśnięty śmiercią swojej partnerki udaje się na odwyk. Gus oferuje Waltowi 3 mln dolarów w zamian za 3 miesiące pracy w jego prywatnym laboratorium, usytuowanym pod pralnią, której Fring jest właścicielem. Walt na początku odmawia, jednak w końcu daje się namówić i rozpoczyna pracę, na początku współpracując z bardzo bystrym chemikiem o imieniu Gale, a następnie z Pinkmanem. Jak się okazuje, Gale był przygotowywany przez Fringa do samodzielnej produkcji metamfetaminy.

Meksykański kartel pragnie śmierci Walta w związku z jego udziałem w zabójstwie Tuco. Gus wyjawia mordercom z kartelu – kuzynom Tuco, iż został on zabity przez Hanka Schradera – co ściąga na agenta DEA wyrok śmierci. Hank przeżywa atak i zabija morderców, jednak jego stan zdrowia jest fatalny. Skyler i Walt oferują pieniądze na leczenie szwagra, okłamując jego żonę mówiąc, że Walt zdobył pieniądze nałogowo grając w hazard.