Jedynym odcinek który udało się zmodernizować do 2015 roku był Sosnowiec Jęzor – Jaworzno Szczakowa, na wszystkie pozostałe PKP PLK ogłosiło nowe przetargi na ich modernizację: Data ogłoszenia przetargu Data podpisania umowy Zakres robót Wykonawca Cena brutto 17 kwietnia 2014 27 stycznia 2016 Krzeszowice – Kraków Mydlniki Vias y Construcciones Dragados Electren 352 mln zł 8 grudnia 2014 16 listopada 2016 Kraków Mydlniki – Kraków Główny Towarowy Torpol 304 mln zł 23 września 2015 29 grudnia 2016 Jaworzno Szczakowa – Trzebinia Trakcja PRKiI (lider) Comsa PKP Energetyka Porr Polska Construction Porr Bau 365 mln zł 24 września 2015 2 października 2017 Trzebinia – Krzeszowice Torpol Budimex 597 mln zł
Pierwsze prace (roboty rozbiórkowe oraz wycinka drzew) na odcinku Krzeszowice – Kraków Mydlniki rozpoczęły się w lutym 2016, a prace związane z wstrzymaniem ruchu w sierpniu. Na początku 2017 roku natomiast rozpoczęły się prace na odcinku Kraków Mydlniki – Kraków Towarowy.