Po prowizorycznej naprawie w Gibraltarze, we wrześniu udał się na remont do USA, trwający do lutego 1942 (stocznia Philadelphia Navy Yard). Po powrocie do Wielkiej Brytanii w kwietniu, przeprowadzono dalsze prace, m.in. instalując nowe radary (kierowania ogniem Type 284 i Type 285 oraz wykrywania nawodnego Type 273). 2 maja 1942 powrócił do służby operacyjnej we Flocie Metropolii w Scapa Flow.
Arktyka i Morze Śródziemne 1942 25 czerwca 1942 „Manchester” wraz z niszczycielem „Eclipse” przetransportował zaopatrzenie i żołnierzy dla garnizonu na Spitsbergenie (operacja Gearbox). 3 lipca został skierowany do osłony konwoju PQ-17 do ZSRR, w nocy 4 lipca odwołano okręty eskorty i konwój rozwiązano (poniósł on następnie ciężkie straty).
Od początku sierpnia „Manchester” został skierowany ponownie na Morze Śródziemne, w celu osłony dużej operacji dowozu zaopatrzenia dla Malty Pedestal. Wchodził w skład zespołu X, bezpośrednio eskortującego konwój i brał udział w intensywnych walkach z lotnictwem niemieckim i włoskim 11 i 12 sierpnia. Po godz. 1.07 w nocy 13 sierpnia „Manchester” został poważnie uszkodzony jedną torpedą w prawą burtę przez włoskie kutry torpedowe MS 16 i MS 22Harald Fock: Fast Fighting Boats 1870-1945, Naval Institute Press, Maryland 1978, , s. 169;