Glinki 40od 30 października 1999 r..
Po wydzieleniu przez papieża Jana Pawła II diecezji bydgoskiej w 2004 r. przez 3 lata duchacze gościli u siebie Wyższe Seminarium Duchowne Diecezji Bydgoskiej, do czasu jego przeniesienia do własnego budynku przy ul. Grodzkiej.
Architektura Kościół Ducha Świętego zajmuje parter jednego z budynków, w którym mieszczą się pomieszczenia Zgromadzenia Ducha Świętego. Jest ona podzielona na trzy nawy rzędami filarów.
Wnętrze Wewnątrz świątyni znajdują się trzy ołtarze: ołtarz główny, neobarokowy, częściowo pozłacany z 1952 r. autorstwa artysty rzeźbiarza Kryski z Bydgoszczy; W centrum znajduje się obraz „Zesłanie Ducha Świętego” autorstwa artysty malarza Leona Drapiewskiego z Poznania. ołtarz w lewej nawie z obrazem Matki Boskiej Częstochowskiej, ołtarz w prawej nawie z obrazem upamiętniającym pierwszą rocznicę wyboru papieża Jana Pawła II.
Kompleks duchaczy Kościół Ducha Świętego stanowi jeden z elementów kompleksu zabudowań Zgromadzenia Ducha Świętego w Bydgoszczy, w skład którego wchodzą ponadto: Dom Prowincjalny, Wyższe Misyjne Seminarium Duchowne (od 1976 roku), Biblioteka Seminaryjna, Archiwum Prowincjalne, Redakcja „Posłańca Ducha Świętego”, Radio PLUS-Bydgoszcz, Muzeum Misyjne.
Kompleks otacza rozległy park z ogrodem oraz obiektami sportowymi służącymi seminarzystom.