Bohaterem serii jest siedemnastoletni detektyw , który pomimo swego młodego wieku i faktu uczęszczania do liceum wiele razy wspierał policję w śledztwach dzięki czemu zyskał ogromną sławę. Pewnego dnia, podczas wypadu do lokalnego parku rozrywki ze swoją przyjaciółką , chłopak był świadkiem transakcji przeprowadzanej przez podejrzanych mężczyzn. Wtedy to, jeden z nich zaatakował go od tyłu, po czym podano mu nową, nietestowaną do tej pory truciznę – APTX 4869. Napastnicy zniknęli, a ciało detektywa zmniejszyło się do rozmiarów siedmioletniego dziecka. Za namową przyjaciela rodziny – profesora , detektyw ukrywa swoją tożsamość pod zmyślonym imieniem i nazwiskiem i jako postanawia odnaleźć przestępców i znaleźć sposób na odzyskanie dawnego ciała.
Media Manga Manga Meitantei Conan została stworzona w 1994 roku przez Gōshō Aoyamę podczas wzrostu publikacji mang z gatunku kryminału ze względu na publikację serii Zapiski detektywa Kindaichi; pierwsze rozdział jego twórczości pojawiły się w czasopiśmie Shūkan Shōnen Sunday wydawnictwa Shōgakukan 19 stycznia. Przytacza on historie o Arsènie Lupin, Sherlocku Holmesie i filmy samurajskie Akiry Kurosawy jako czynniki wpływające na swoją pracę.