Lista najważniejszych produktów (w nawiasach zastosowanie kliniczne): Alimta (międzybłoniak, rak płuca niedrobnokomórkowy) Byetta (cukrzyca typu 2.) (rozprowadzany wspólnie z ) Cialis (zaburzenia erekcji) Cymbalta (stany depresyjne) Darvocet (środek przeciwbólowy) Effient (środek antytrombotyczny) E-Mycin (antybiotyk przeciwko infekcjom układu oddechowego) Evista (osteoporoza, zmniejszenie ryzyka raka piersi) Forteo (osteoporoza) Glucagon (hipoglikemia) Gemzar (rak trzustki) Humalog (cukrzyca typów 1. i 2.) Humatrope (GH stosowany przy dziecięcych zaburzeniach wzrostu) Humulin (cukrzyca typów 1. i 2.) Methadone (terapia uzależnień od narkotyków) Prozac (stany depresyjne) ReoPro (operacje angioplasyczne obarczone dużym ryzykiem) Secobarbital (epilepsja, bezsenność) Strattera (ADHD) Symbyax (choroba dwubiegunowa) Thimerosal (szczepionki starszego typu) Trulicity (cukrzyca typu 2.) Xigris (sepsa o ostrym przebiegu) Zyprexa (schizofrenia i choroba dwubiegunowa)
Kontrowersje Eli Lilly był wielokrotnie uczestnikiem sporów związanych z problemami etycznymi i kontrowersji na tle politycznym.