New Horizons otrzymał wynik wyższy od misji na Księżyc, a nawet na Jowisza. Weiler stwierdził, że był to skutek tego, że „[jego] administracja nie zamierzała walczyć”. Po opublikowaniu raportu ostatecznie zapewniono finansowanie misji. Zespołowi Sterna w końcu udało się rozpocząć budowę statku kosmicznego i jego instrumentów, planując wystrzelenie w styczniu 2006 r. i przybycie na Plutona w 2015 r. Alice Bowman została menedżerem ds. operacji misji (ang. Mission Operations Manager - MOM).
Cele misji Wykonanie map składu powierzchni Plutona i Charona. Zbadanie budowy geologicznej i morfologicznej Plutona i Charona. Zbadanie atmosfery Plutona i tempa jej utraty. Poszukiwanie atmosfery wokół Charona. Pomiary temperatury powierzchni Plutona i Charona. Poszukiwanie pierścieni i nowych księżyców Plutona. Obserwacja zmian w czasie występujących na powierzchni i w atmosferze Plutona. Wykonanie stereoskopowych zdjęć Plutona i Charona. Obserwacja jonosfery Plutona i jej interakcji z wiatrem słonecznym. Poszukiwanie pola magnetycznego Plutona i Charona. Uzyskanie dokładniejszych wartości podstawowych parametrów fizycznych (promień, masa, gęstość) i elementów orbity Plutona i Charona.